- İçme-kullanma suyu kaynaklarının miktar ve kalitesinin korunmasına ve sürdürülebilir kullanımına, arıtımına yönelik ilke, hedef, politika ve stratejileri tespit etmek ve mevzuat hazırlamak,

- İçme-kullanma suyu havzası koruma planlarını hazırlamak, hazırlatmak veya koordine etmek, koruma planları ile ilgili diğer iş ve işlemleri yürütmek, uygulamaları takip etmek,

- İçme-kullanma suyu havzası koruma planları ile ilgili mevzuat çalışması yapmak, rehber dokümanları oluşturmak,

- İçme-kullanma suyu güvenliği planlarını hazırlatmak, uygulamaları takip etmek, mevzuat çalışmalarını yapmak ve rehber dokümanları oluşturmak,

-  İçme-kullanma suyu kaynaklarının arıtma kategorilerini belirlemek, içme suyu arıtma tesislerinin giriş ve çıkış suyu kalitesini takip etmek ve bu tesislerin durumunu değerlendirmek,

- İçme-kullanma suyu arıtma tesisleri için tasarım esaslarını, normlarını ve kriterlerini belirlemek; su arıtma tesisi projelerini onaylamaya yetkili kurum ve kuruluşları tespit etmek; tesisleri işletecek elemanların eğitim almalarını sağlamak ve sertifikalarını vermek,

- İçme-kullanma suyu arıtma tesisleri ön proje raporlarını onaylamak,

- Atıksu arıtma tesislerinin tasarım esaslarını ve kriterlerini Çevre, Şehircilik ve İklim Değişikliği Bakanlığı ile birlikte belirlemek,

- Arıtma teknolojileri konusunda ulusal ve uluslararası gelişmeleri izlemek, gelişmiş teknolojilerin ülkeye kazandırılması için çalışmalar yapmak, arıtma teknolojileri konusunda özel kuruluşlar ile kamu kurum ve kuruluşları arasında işbirliği yapılması için koordinasyon sağlamak, teknolojik araştırma geliştirme çalışmaları yapılmasına destek vermek, 

- Daire başkanlığı görev alanına giren hususlarda ulusal ve uluslararası çalışmaları takip etmek, mevzuat hazırlamak, ihtiyaç duyulan konularda rehber doküman hazırlamak ve eğitim yapmak veya yaptırmak,

- Mevzuat ile belirlenen faaliyet ve yatırımların su kaynaklarına ve su kütlelerine etkisi konusunda kurum görüşü oluşturmak, bu konuda ilgili kurumlara görüş vermek.