Müdürlüğümüz 2006 yılında kabul edilen 5553 Sayılı “Tohumculuk Kanunu” hükümleri ve bu kanuna ek olarak çıkarılan yönetmelik, talimat, tebliğ ve tamimler doğrultusunda hizmetlerini yürütmektedir. Müdürlüğümüzün görevleri: 

1. Tescil edilen veya üretim izni verilen ve Milli Çeşit Listesinde yayımlanan çeşitlere ait tohumlukların kontrol ve sertifikasyonu ile ilgili çalışmaları yürütmek,
2. Müdürlüğümüze gelen tohumluk numuneleri üzerinde fiziksel, biyolojik ve diğer laboratuvar analizlerini yaparak gerekli belgelendirmeyi yapmak,​
3. Elde ettiği sonuçları internet ortamında Tohumluk Veri Yönetim Sistemine ve Tohumluk Doğrudan Gelir Desteği ödemelerinde kullanılacak veri sistemine girmek,​
4. Ayrıca bulunduğu ilde veya görev verildiğinde diğer illerdeki OECD amaçlı tohumluk üretimlerinin tarla kontrollerini yapmak,​
5. Arazi tahsisi yapılmasıyla birlikte tohumlukların arazi denemelerini kurmak,
6. Tohumluk post kontrol ve tescil denemelerini yapmak, 
7. Bitkisel Üretim Genel Müdürlüğünün 2019/1 genelgesi ile Tohum İthalatı Ön İzni işlemlerini yapmak,
8. Bitkisel Üretim Genel Müdürlüğünün 2019/2 genelgesi ile Fidan, Üretim Materyali ve Fide İthalatı Ön İzni işlemlerini yapmak,
9. Bitkisel Üretim Genel Müdürlüğünün 2019/3 genelgesi ile Süs Bitkileri İthalatı Ön İzni işlemlerini yapmak,
10. Bitkisel Üretim Genel Müdürlüğünün 2019/4 genelgesi ile Tohumluk İhracatı Ön İzni işlemlerini yapmak,
    
11. Tarım ve Orman Bakanlığı, Bitkisel Üretim Genel Müdürlüğü ve Tohumculuk Daire Başkanlığının kendisine vereceği diğer görevleri yapmaktır.​