- Suyun havza ölçekli yönetimi ve su kaynaklarının etkin ve verimli bir şekilde korunması, geliştirilmesi ve kullanılmasına dair ilke, strateji ve hedefleri tespit etmek,
- Ulusal su planı hazırlama çalışmalarını yürütmek ve gerekli koordinasyonu sağlamak,
- Havza Koruma Eylem Planlarını ve Havza Yönetim Planlarını hazırlamak ve güncellemek,
- İçme Suyu Havzaları Koruma Planlarını hazırlamak ve güncellemek,
- Havza esaslı sektörel su tahsisi planlarını hazırlamak, bu hususta yapılacak faaliyetleri koordine etmek, iş ve işlemleri yürütmek, Su Yönetimi Yüksek Kurulu'na sunulacak raporları hazırlamak,
- Su kaynakları ile ilgili havza esaslı sektörel su tahsisi sicilini tutmak ve bununla ilgili iş ve işlemleri yürütmek,
- Su ile alakalı havza ölçekli yönetim planlarının takibi ile ilgili ilke, esas, stratejileri ve politikaları belirlemek,
- Havza Koruma Eylem Planlarının uygulamalarını havza ve il ölçeğinde takip etmek ve raporlamak,
- Havza Yönetim Planlarının ve İçme Suyu Havzaları Koruma Planlarının uygulamalarını takip etmek ve raporlamak,
- Sektörel su tahsis uygulamalarını havza ölçeğinde takip etmek ve raporlamak,
- Su Yönetimi Yüksek Kurulu'nun sekreterya hizmetlerini yürütmek,
- Havza Yönetim ve İl Su Yönetimi Koordinasyon Kurullarının çalışmalarını koordine etmek raporlarını değerlendirmek ve üst kurullara raporlamak,
- Daire Başkanlığı görev alanına giren hususlarda ulusal ve uluslararası çalışmaları takip etmek ve raporlamak, mevzuat hazırlamak, ihtiyaç duyulan konularda rehber doküman hazırlamak ve eğitim yapmak veya yaptırmak.